腦血栓形成發生后,盡快的恢復腦缺血區的血液供應是急性期的最主要的治療原則,發病后6小時內,采用溶栓治療,使血管再通和減輕腦水腫,常用的藥物有:重組組織型纖溶酶原激活物、藥劑酶,腦血栓形成患者急性期的血壓,應維持在發病前平時稍高的水平,除非血壓過高,如收縮壓大于220ml汞柱,一般不使用降壓藥,梗死范圍大和發病急躁時,可引起腦水腫,嬰兒進行降低顱內壓的治療,常用的藥物有20%的甘露醇、呋塞米等。
另外還包括抗凝、抗血小板的治療,應用血管擴張劑治療,對大腦大面積梗死、出現顱內高壓危象治療困難時,可行開顱切除壞組織,顱骨減壓術治療。