腎結石部分患者可能終身沒有明顯反應,部分患者導致嚴重腎盂積水才會產生腰酸脹不適,前往泌尿外科就診,此時為時已晚,因為嚴重腎盂積水已經導致腎功能受損,而部分患者腎結石會引起較明顯的血尿或者較重程度的腎絞痛發作,因為結石在體內活動,會與黏膜摩擦,導致黏膜充血水腫,從而黏膜表面毛細血管破裂,血液入尿液當中,因此引起血尿。
而患者在排尿時會容易發現部分尿液當中不可見,在顯微鏡下見到尿液當中有紅細胞,則稱為鏡下血尿。而腎結石與黏膜摩擦過程當中以及掉入到輸尿管也會引起輸尿管痙攣,導致腎盂內高壓,從而誘發腎絞痛,患者一般常伴劇烈疼痛,部分患者會有惡心嘔吐等癥狀。