紅斑狼瘡和其他自身免疫性疾病一樣,還未能找到確切的病因,但一般認為它與遺傳感染內分泌以及環境等因素有關。遺傳是紅斑狼瘡發病的重要因素,具有紅斑狼瘡遺傳因素的人,一旦遇到某些環境中的誘發條件,就會引起該病。
此外感染,有人認為本病與鏈球菌或者結核桿菌感染有關,但是尚未得到充分的證實。
內分泌因素,紅斑狼瘡多發生于育齡婦女,在兒童和老年患者中幾乎無性別差異,因此提示雌激素可能在本病的發病中,有一定的影響。
另外環境因素是直接誘發紅斑狼瘡的因素,物理因素比如紫外線照射,化學因素如藥物等,也是可以加重紅斑狼瘡的。此外在日常生活中如果飲食不當,吃了蝦蟹、韭菜、蘑菇等等或者住進新裝修的房屋染發等都有可能誘發紅斑狼瘡。