絕大多數附睪炎患者在藥物治療后,癥狀會自行消失,附睪炎一般處理,注意臥床休息,應用陰囊托和軟墊,托起陰囊,以減輕癥狀疼痛,嚴重者可用止痛藥,局部熱敷,可緩解癥狀,并可促進炎癥消退,但是不宜過早使用熱敷,以免加重疼痛,促進感染擴散的危險,因此早期易用冰袋局部冷敷。另外,為防止進一步加重感染,還應避免性生活和體力勞動。
藥物治療,主要是按照細菌培養的結果,以及抗菌藥物敏感實驗,來選擇對細菌感染敏感的抗生素,常規選擇靜脈途徑給藥,一般治療一到兩周后,改為口服藥,兩到四周,以防止其轉為慢性。
其次,急性衣原體性附睪炎的治療,多采用大環內酯類抗生素聯合皮質激素,療程較長。另外,對同時存在的前列腺炎,精囊炎及尿道炎,也需要進行治療。