在慢性腎功能衰竭的時候腎臟濾過毒素的能力就減退,從而體內代謝的產物就容易潴留,同時腎臟排出磷元素減少導致血磷升高,這種情況就會導致胃腸道消化道的吸收鈣的減少,從而血鈣降低,會刺激甲狀旁腺激素分泌增多導致繼發性甲狀旁腺功能亢進。高血磷癥還會抑制羥化酶的活性,使腎臟產生的活性維生素d減少。
另外,由于體內代謝的酸性物質排不出去,從而就會導致代謝性的酸中毒,酸性物質過多就會引起骨骼的溶解吸收加快,從而就會導致骨質疏松癥。慢性腎功能不全的患者,這時候飲食已經非常少了,所以從源頭上補充鈣質也不夠充足,所以就會導致骨質疏松癥。