腦血栓主要的病因是由于動脈粥樣硬化,其次包括高血壓高血脂高血糖和高通性伴高血癥,大多數患者發生于中老年人,而腦栓塞主要的病因是由于血液中的各種栓子脫落而引起,主要包括心臟內的附壁血栓和動脈粥樣硬化的斑塊,脂肪和腫瘤細胞等等。
臨床上引起腦栓塞常見的疾病主要有心房顫動,心肌病心肌梗死,先天性心臟病、感染性心內膜炎,心臟黏液瘤等等。腦栓塞可發生于任何年齡,該病是起病速度最快的一種腦梗死,癥狀常常在數秒或數分鐘之內達到高峰,大多數患者為完全性卒中。而腦血栓的患者大多數在數分鐘數小時內病情達到高峰,臨床上分為進展性腦卒中和完全性腦卒中,進展性腦血栓的患者,是指患者發病后數小時病情仍在進展。