對于復發性口腔潰瘍,治療的方法應該以消除病因、增強體質、對癥治療為主,堅持全身治療和局部治療相結合,心理治療和生理治療相結合。口腔潰瘍壞損的局部可以使用口腔炎噴霧劑或者西瓜霜外用。也推薦使用成纖維細胞生長因子類的藥物來促進潰瘍表面的粘膜,重生愈合以便達到恢復創面、愈合潰瘍、減輕疼痛的目的。
此外,還要注意保持口腔清潔,每日使用抗菌消炎藥,同時每日使用漱口水適當漱口,同時鍛煉身體,提高體抵抗力、免疫力。還有每日要適當的補充微量元素及維生素,一般來說兩周左右,口腔潰瘍即可自愈。
如果長期患有免疫系統疾病,并復發性口腔潰瘍的患者,可以應用一些免疫抑制類的藥物來調節免疫,能夠盡量減緩復發性口腔潰瘍間隔的時間,減少每次發作的持續時間。