目前研究表明,結腸炎發病的原因跟自身免疫反應有關系,因為該病并發自身免疫病者比較多。腎上腺皮質激素能夠使病情緩解,在部分患者的血清中能夠查到抗結腸上皮細胞抗體,所以說該病跟自身免疫反應有著密切的關系,
再就是感染因素該病的病理變化,以及臨床表現與一些結腸感染性疾病,比如細菌性痢疾有相似的地方。所以說跟感染有關系主要考慮跟某些細菌、病毒、真菌感染有關。
另外結腸炎跟遺傳因素也有關,目前的研究表明,結腸炎患者有很多都具有一些家族史的情況。這就是跟神經、精神因素有關,患者多有某些性格特征,對于生活中重大事件的心理承受能力適應性比較差,屬于心身疾病的一類。心身疾病強調心理因素在疾病的發生或者病程中起重要作用,所以說結腸炎發病的原因比較復雜,主要就是跟自身免疫因素,感染,遺傳精神因素有密切關系。