傳染性非典型肺炎主要是經過空氣、唾液傳播,潛伏期一般是1-16天,常見為3-5天,起病急,以發熱為首發癥狀,可有畏寒,體溫常超過38攝氏度,呈不規則熱或弛張熱、稽留熱等,熱程多為1-2周,伴有頭痛、肌肉酸痛、全身乏力和腹瀉。
起病3-7天后出現干咳、少痰,偶有血絲痰,肺部體征不明顯,病情于10-14天達高峰,發熱、乏力等感染中毒癥狀加重并出現頻繁咳嗽、氣促和呼吸困難,略有活動則氣喘、心悸,被迫臥床休息。
這個時期易發生呼吸道的繼發感染,病程2-3周后發熱漸退,其它癥狀與體征漸減輕乃至消失,肺部炎癥改變的吸收和恢復則較為緩慢,體溫正常后仍需2周左右才能完全吸收,恢復正常,輕型的臨床癥狀輕,重型患者病情重,易出現呼吸窘迫綜合征。