需要明確的是如果患者進行及時的治療的話,肝內膽管結石一般來說是可以治療好的。目前在臨床上主要采取手術治療的方式治療肝內膽管結石,它的原則為盡可能的取盡石頭,解除膽道狹窄及梗阻,去除結石部位和感染病灶,恢復和建立通暢的膽汁引流,防止結石的復發。手術的方式包括膽管切開取石,這是最基本的方法,應該爭取切開狹窄的部位,沿著膽總管向上甚至可以達二級膽管,直視下或者通過術中的膽道鏡將石頭取出,直到石頭取出干凈。如果難以取凈的局限性結石,需要行肝切除時,可以高位膽管切開以后行膽腸吻合術,這樣的話既可以解除病變,又保留了膽汁通暢引流。
另外,如果肝內膽管結石反復發作并感染,引起局部的肝萎縮的情況下,可以考慮切除病變部分的肝臟,包括結石和感染病灶一并切除,這樣的話既保證了治療的效果,也提高了患者預后的可能。