如果得了直腸炎我們可以進行抗感染治療,可以根據細菌和藥敏結果選用比較敏感的抗生素和環丙沙星,甲硝唑,同時可以給予水楊酸制劑,包括柳氮磺嘧啶、美沙拉嗪等,癥狀比較明顯的可以給與柳氮磺嘧啶等抗生素保留灌腸。癥狀加重或是癥狀處于急性期可以給予糖皮質激素,如強的松、地塞米松等,目前并不認為應用長期激素可以防止復發。
對癥治療可以使用胃腸道解痙劑阿托品、硝苯地平、止瀉藥可用思密達。對于患者嚴重腹瀉可以使用調節腸道菌群的藥物,比如說像雙歧桿菌、乳酸桿菌等。患者存在便秘的情況可以口服促進胃腸道蠕動的藥物,如莫沙必利等。得了直腸炎其主要治療方法需要臥床休息、全身營養支持治療的同時對因治療。