廣義而言,凡是可以導致結腸慢性炎癥的病均可稱為慢性結腸炎,是一種慢性,反復性,多發性因各種致病原因導致腸道的炎性水腫,潰瘍和出血病變,狹義而言,單純指的是潰瘍性結腸炎,慢性結腸炎發病原因尚未清楚,病因復雜,一般認為和感染免疫遺傳環境,食物過敏,防御功能障礙及精神因素有關。
慢性期以保守治療為主,爆發型和內科治療不佳的可采與外科手術治療,中藥方劑可采用葛根芩連湯,青蒿鱉甲湯,參芩白術丸,四逆湯和四神湯等方劑加減來治療,西藥可采用對癥治療,可分為液體和電解質平衡抗感染藥物,胃腸解痙藥物,止瀉藥,腸道菌群調節藥,增加胃腸蠕動藥和緩解便秘藥物等來對癥治療。