目前的研究已經證實,在反應性關節炎病人關節的滑膜組織、滑膜液及其沉淀物,這樣一些關節內的組織中存在有致病微生物,如衣原體,及其他菌體的成分如DNA或其他抗原部分。而且還可以通過電鏡從關節的滑膜組織中,看到整個衣原體結構,衣原體RNA,以上情況強烈提示,在不久以前,衣原體還是活的。
有人研究了沙門菌感染后的反應性關節炎,證實在滑膜液細胞中,存在有沙門菌的脂多糖,與反應性關節炎發病有著重要的聯系。根據目前的研究可知感染人體的微生物及其成分,可以通過下列途徑到達關節。1、血液傳播及通過血管漏出到關節里。2、細胞攜帶,如衣原體被白細胞吞噬后,被攜帶到關節里。