早期的話可以進(jìn)行保守治療，但是后期的話建議還是采用手術(shù)治療，用一些藥膏來(lái)進(jìn)行保守治療，比如可以考慮用馬應(yīng)龍痔瘡軟膏或者是肛泰，這些都能夠起到患處的消炎止痛和止癢的作用，但是僅用藥一般不可以解決實(shí)際的問(wèn)題。
肛瘺一般有內(nèi)口，外口，內(nèi)口在直腸壁，外口在肛門(mén)的邊緣，瘺口的大小會(huì)隨著膿液的流動(dòng)而改變，患者一定要注意，除了用藥膏涂抹之外，每天的晚上最好是進(jìn)行一些中藥的熏洗，坐浴，可以選擇一些高錳酸鉀溶液泡水，要注意水的溫度不能太熱，也不能太涼，每天泡十五分鐘左右就可以，在患者每次解大便時(shí)，一定要注意局部周?chē)那鍧嵭l(wèi)生，通過(guò)預(yù)防細(xì)菌的感染和入侵來(lái)治療肛瘺或者是防止肛瘺的加重。
如果抹藥效果不好的話，是一定要進(jìn)行手術(shù)治療的，一般臨床上引起肛瘺的主要因素有抗力下降，肛周膿腫是一個(gè)感染性的疾病，正常人有抵抗力的時(shí)候不容易感染，但是如果患者抵抗力下降，比如說(shuō)經(jīng)常的熬夜，勞累等等，全身的抵抗力免疫力下降的時(shí)候就會(huì)形成肛周膿腫，而一些刺激性的因素比如說(shuō)經(jīng)常的酗酒，愛(ài)吃辣椒，這些因素也會(huì)引起肛周膿腫的發(fā)生，如果肛周膿腫破潰就會(huì)形成感染，造成肛瘺的發(fā)生。
