先天性腦積水的治療以外科手術治療為主,首先是解除病因的手術,如果是顱內腫瘤或者是顱內膿腫引起的腦積水,需要手術清除腫瘤和膿腫,恢復腦脊液循環通路。如果是中腦導水管阻塞造成的腦積水,可以做中腦導水管再通或成型術。
再就是腦脊液分流手術,是用來腦脊液循環通路的改造,使腦脊液利于吸收,可分為顱內腦脊液分流術,如側腦室,小腦延髓池分流術,第三腦室造瘺術,還有顱外腦脊液分流術,有腦室腹腔分流術,腦室心房分流術。
還有一種就是減少腦脊液分泌的手術,如切除或電凝腦室內的脈絡叢,上面說的這些手術可以用開顱或神經內鏡下進行,而近期由于神經內鏡的微創性,目前神經內鏡的手術居多。