甲減當中原發性甲減比較多見,約占甲減癥的96%,是由于甲狀腺本身的疾病所引起。根據臨床所見有因服用抗甲狀腺藥物引起的慢性淋巴細胞性甲狀腺炎、甲亢或甲狀腺癌的甲狀腺大部分切除術后,放射性碘治療后,先天性甲狀腺缺如或者是克汀病。舌甲狀腺緊急性纖維性甲狀腺炎、致甲狀腺腫的物質引起先天性甲狀腺激素生成障礙,甲狀腺的轉移瘤以及慢性地方性碘缺乏所引起的等等。
繼發性甲減比較少見,是由于垂體疾病使TSH分泌減少引起的,如垂體瘤,席漢氏綜合癥、非腫瘤性選擇性TSH缺乏,卒中,垂體手術或者是腦垂體部位放射治療以后引起。
第三性甲減比較罕見,是由于下丘腦產生促甲狀腺激素釋放激素的減少,使得垂體的tsh分泌減少而引起的。