幽門螺桿菌感染是消化性潰瘍的主要病因,胃潰瘍和十二指腸潰瘍的幽門螺桿菌的感染率一個是在80%以上,一個是在90%以上。根除幽門螺桿菌可以促進潰瘍的愈合,顯著的降低潰瘍的復發,所以這些都足以證明它在消化性潰瘍發病中的作用。
幽門螺桿菌憑借其毒力因子,在胃黏膜定植,誘發局部的炎癥和免疫反應,會破壞局部黏膜的防御和修復機制,幽門螺也可以增加胃泌胃酸和胃泌素的分泌,兩者的協同作用就會造成胃十二指腸黏膜損害潰瘍的形成。它的毒素和有毒性的酶誘導的黏膜炎癥反應均能會導致胃和十二指腸黏膜的損害,可以造成細胞產生空泡。尿素酶分解尿素會產生氨和二氧化碳,氨除了對幽門螺本身有保護作用外,還可以造成黏膜屏障的損害。