任何手術都有風險,近視眼激光手術也不能完全避免并發癥。最常見的并發癥就是過度矯正或矯正不足,這些要經過一定時間觀察,酌情二次手術。
部分人可出現眩光及夜間將一個光點看成光團,這可因術后角膜組織間輕微水腫反應或夜間瞳孔較大及邊緣與手術緣靠近有關,隨手術后時間推移而逐漸減輕。圓錐角膜在有這種潛質或者手術后角膜過薄的人身上出現,因為注視目標不良,可能出現偏心切削和或因角膜表面水氣漩的作用出現中心島。
最嚴重的是手術眼角膜傷口的感染,雖然極少發生,確是可以致盲的直接原因。所以嚴格的手術消毒制度和患者良好的衛生習慣至關重要。手術后也應定期檢查眼睛,特別注意眼底黃斑區和周邊視網膜的變化,做到未雨綢繆。