十二指腸潰瘍的疼痛位置一般位于上腹部,上腹部經常會出現鈍痛或者是灼傷一樣的疼痛,有一些患者還會出現脹痛或者是劇烈的疼痛,多數表現在饑餓的時候隱痛不適,典型的一些患者還會出現輕度或者是中度劍突下持續性的疼痛,可被制酸劑或者是進食的時候能夠有所緩解。
在大臨床上大約有三分之二的患者疼痛都會呈現節律性,一般在早餐后一到三個小時開始出現上腹疼痛的情況,如果不服用藥物或者進食則會持續到午餐才能夠緩解,一般還有患者在進食后兩到四個小時之后又出現疼痛,進餐后仍然能夠緩解,大約半數的患者還有午夜疼痛的情況,患者經常被疼痛的醒來。