內分泌的因素也是牙周病的危險因素,內分泌功能紊亂會對牙周病的發生和發展起到重要的影響。在牙齦的細胞中,含有很多特異性的雄激素和雌激素的受體,牙齦是一些性激素的靶器官。
婦女在生理和非生理性的情況下,激素的變化會導致牙周組織的明顯改變。如果原來就有菌斑誘導的炎癥,會加重炎癥的程度,就像妊娠期齦炎,就是妊娠婦女的菌斑指數雖然與妊娠前沒有明顯的改變,但是牙齦的炎癥會有明顯的加重。同樣青春期的牙齦炎也是由于激素水平的變化而導致的。對于這些炎癥的狀況在生理時期過去之后炎癥可以消減。因此內分泌因素也是牙周病的一個相關危險因素。