橋本甲狀腺炎與甲狀腺原惡性腫瘤共存或者是淋巴瘤可由橋本甲狀腺炎惡變而來,也已得到公認。目前對橋本甲狀腺炎和甲狀腺癌的關系仍有爭議,但在橋本甲狀腺炎患者中甲狀腺癌較高的檢出率也提示了甲狀腺炎有發展為甲狀腺癌的潛在可能,與橋本甲狀腺炎共存的甲狀腺癌組織學類型以乳頭狀癌最為常見。
橋本甲狀腺炎的患者也可以發現與濾泡狀或者髓樣癌共存,也有部分是演變為鱗狀細胞癌,但是橋本甲狀腺炎合并甲狀腺癌病理診斷必須在同一病例中,有相關的病理學形態依據嚴格診斷,可疑的患者必須經過病理學的檢查。
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