首先人體的造血干細胞具有很強的再生能力,對于輸血或者是捐獻造血干細胞之后,可以刺激骨髓加速造血,在一到兩周內血液中的各種血細胞可以恢復到原來的水平,但是捐獻者由于動員藥物的應用,可能會出現短期的不適感,有八成的患者,在用藥之后會出現輕中度的骨痛,但是能用普通的止疼藥物大多能夠得到有效的緩解。
其他的還有一些過敏反應,皮損傷、咳血、急性呼吸總迫癥乃至死亡的發生,這些副作用在臨床上的也有報道,但是對于一些健康的骨髓捐獻者還是十分罕見的,另外還有一些捐獻后的患者會出現明顯的頭疼、惡心的癥狀,以女性捐獻者發病率是最高的。