導致十二指腸潰瘍的主要病因有遺傳因素,遺傳因素對該病的易感性起到重要作用,依據就是患者家族的高發病率。再就是遺傳基因的一些標志物,另外是長潰瘍患者的同胞中十二指腸潰瘍發病率比一般人群要高兩倍以上。再就是十二指腸粘膜防御機制的減弱,比如酸化反應,再就是返回性延緩外的排空。
還有就是十二指腸黏膜能吸收腔內氫離子和不受膽鹽損傷,十二指腸潰瘍患者中這種反饋未排空和抑制胃酸的作用會減弱,可能會造成黏膜受損,導致潰瘍。再就是胃酸分泌過多,往往會導致,局部十二指腸黏膜受損,另外幽門螺桿菌的感染直腸潰瘍發生有著密切的關系。其他的一些因素比如長期的應用非甾體類消炎藥,大量地吸煙飲酒,應激反應,飲食方面不規律都可能會引發十二指腸潰瘍。