大多數慢性前列腺炎并沒有急性炎癥的過程,主要是由致病菌進入尿道,由尿道逆行感染進入前列腺導致,常見的致病菌有大腸埃希氏菌,變形桿菌,肺炎克雷伯菌,葡萄球菌或者鏈球菌,也可由淋球菌感染所致。
組織學上將前列腺身為內層和周圍層,內層腺管為順形性,而周圍層腺管呈逆行導流,射精時如果有后尿道感染會導致致病菌大量擠向周圍層,如果有排尿不暢,感染的尿液也可經前列腺管逆流前列腺組織,形成鈣化或者結石。因此前列腺炎容易由久坐、熬夜、頻繁手淫導致。
另外前列腺的腺上皮它是一種內脂質膜,很多抗菌素難以穿透這個屏障,所以慢性前列腺炎治療比較慢,這就是慢性前列腺炎發病的機理。