眼睛結膜炎治療以去除病因抗感染治療為主,在等待實驗室結果時,開始局部使用廣譜抗生素,確定致病菌術后給予敏感抗生素,根據病情的輕重,可選擇結膜囊沖洗,局部用藥,全身用藥和聯合用藥。切勿包扎患眼,但可佩戴太陽鏡,以減少光線的刺激。
對于超急性的細菌性結膜炎,治療應在診斷性標本收集后立即進行,以減少潛在的角膜以及全身感染的發生,局部治療和全身用藥并重,成人急性或亞急性細菌性結膜炎一般選擇滴眼劑,有0.3%的妥布霉素眼藥水和左氧氟沙星眼藥水等。兒童則選擇眼膏,避免用滴眼劑哭泣時隨眼淚排出,而且其作用時間更長。
慢性細菌性結膜炎治療基本原則與急性相同相似,需長期治療,療效取決于患者對治療方案的依從性,各種類型的結膜炎波及角膜時,應按照角膜炎的治療原則進行處理。