新生兒敗血癥由于誤診等,治療往往不太得力,因此易造成很嚴重的后果,最重要的并發癥是化膿性腦膜炎、肺炎、肺膿腫、骨髓炎、腎盂腎炎及蜂窩組織炎等,這些并發癥都是重癥,一是病死率高,二是后遺癥多。化膿性腦膜炎的后遺癥,自不必說,骨髓炎造成肢殘,腎盂腎炎,也可成為終身疾患。
新生兒敗血癥還會影響寶寶的智力發育,如果不能及時徹底的治療,可能導致高膽紅素血癥甚至和黃疸及化膿性腦膜炎發生,影響小兒智力發育。預防新生兒敗血癥刻不容緩,孕婦定期做產前檢查,分娩過程中嚴格執行無菌操作,對胎膜早破、宮內窒息和產程過長的新生兒應進行預防性治療。