對于慢性腹瀉的患兒,首先要注意調整飲食,應該繼續母乳喂養。對于人工喂養兒,應該調整飲食,保證足夠的熱量,對于雙糖不耐受的患兒,而由于有不同程度的原發性或者繼發性,雙糖酶缺乏。
使用含雙糖,包括蔗糖,乳糖,麥芽糖的飲食可以使腹瀉加重,其中以乳糖不耐受最多見,治療上應該采用去雙糖飲食,如采用豆漿或者去乳糖配方奶粉。
對于慢性腹瀉,還可以進行藥物治療,抗生素用于僅分離出特異病原的感染患兒。根據藥物敏感試驗選用,要注意補充微量元素和維生素,如鋅,鐵,鹽酸,維生素a,b12,B1和葉酸等,有助于腸粘膜的修復,應該注意應用微生態調節劑,和腸粘膜保護劑。