CT它的優勢是可以清楚地顯示甲狀腺的解剖結構,判斷甲狀腺病變對鄰近器官的影響,明確腫瘤有沒有鄰近的淋巴結、血管,或者是胸腔上部侵犯轉移等方面,這些都是有較高的臨床價值的。但是需要有一點注意的就是,碘增強劑對甲狀腺疾病可有一定的影響。多層螺旋CT因為沒有運動渦影,所以會在一定程度上提高CT的診斷價值。CT灌注現象也可以顯示形態學變化同時反應生理功能。
磁共振具有軟組織對比度佳,以及區分不同來源組織能力比較強的特點,這種檢查方式對于局灶性的病變的敏感性不是特別高,在確定鈣化方面的診斷價值其實比不上超聲波。現在磁共振有一些現象技術或者是灌注成像,這些方法都是提高了甲狀腺疾病診斷方面的價值。