目前有關此病的病因,至今尚不清楚,可能與多種因素有關,其中包括感染因素和遺傳因素,雖然許多關于細菌,病毒,支原體和衣原體感染。
與本病有關的報道,但是目前都不能證實是誘導本病的直接原因,細菌包括,鏈球菌,志賀菌,空腸彎曲菌,和沙門菌屬等,病毒包括細小病毒b19,風疹和b病毒。
遺傳學方面,目前許多資料證實,幼年特發性關節炎具有遺傳學背景,研究最多的是人類白細胞抗原,也就是HLA,具有HLA,DR4,DR8和DR5為點,這些是幼年特發性關節炎的,易發病人群,其它發病有關的,HLA為點,是DR6和A2等。