有些感染者可無皮疹而僅有發熱、咳嗽等上呼吸道感染癥狀。皮疹分布較廣,在上臂、大腿等區干部位的比例相對較高,約占20%,多以大皰樣皮疹為特點并伴有瘙癢、疼痛。早期皮疹表現為皮膚顏色的米粒大小丘疹,周圍有紅暈,隨后皰疹很快增大形成包皮皰疹。
部分皮疹可以融合,隨病程進展會出現破潰、結痂并伴有脫皮,約30%的病例痊愈后會出現指甲脫落現象,而普通手足口病這一比例則不足5%,治愈后可留下硬痂。CV-A6引起的手足口病臨床特征與其他病原體有所不同,所以容易被誤診或漏診,索性一般不累及循環和神經系統,引起的重癥及死亡比例較小。