川崎病是一種自限性疾病,所以多數的患者預后良好。大概有1%到2%的患兒可以出現川崎病的復發,對于沒有冠狀動脈病變的患兒在出院后一個月、三個月、六個月以及一到兩年,要進行一次全面的體格檢查,包括進行體檢,做心電圖和超聲心動圖等,觀察有沒有心律失常以及心臟結構的改變。
對于未經有效治療的患兒,大約有15%到25%發生冠狀動脈瘤,所以更應長期密切隨訪,每六到十二個月進行一次。冠狀動脈瘤多于病后兩年內自行消失,但是常??赡苓z留管壁增厚和彈性減弱等功能異常。大的動脈瘤常不易完全消失,常常導致血栓形成或者官腔狹窄。