磁共振也就是MRI,是二十世紀八十年代初用于臨床的生物磁學核自旋成像技術,與CT相比它可以直接作出橫斷面、矢狀面、冠狀面和各種斜面的幾層圖像,不會產生CT檢測中的顱骨偽影,不需要注射造影劑,無電離輻射對機體沒有不良影響,可清楚顯示腦干及后顱窩病變等。
MRI圖像對于腦灰質與腦白質可產生明顯的對比度,對檢測腦內血腫、腦外血腫、腦腫瘤、顱內動脈瘤、動靜脈血管畸形、腦梗死、椎管內腫瘤。脊髓空洞癥和脊髓積水等顱腦常見疾病有明顯的優勢,然而MRI檢查對于急性顱腦損傷、顱骨骨折、急性出血病變和鈣化灶不如ct,檢查候時長價格昂貴,對于體內有金屬異物的患者檢查有限制。