流行性腮腺炎可以導致卵巢炎,約有5%到7%的青春期女性患者可以出現并發卵巢炎,癥狀多較輕,可出現下腹痛以及壓痛,月經不調一般不影響受孕。有些患者出現胰腺炎,嚴重的急性胰腺炎較少見,常常發生于腮腺腫大,數日以后表現為上腹部劇痛以及觸痛,同時伴有發熱,寒顫和反復嘔吐等。
由于單純性腮腺炎即可引起血和尿淀粉酶增高,因此淀粉酶升高不能作為胰腺炎的診斷證據,需做脂肪酶檢查有助于診斷,還有并發癥是耳聾,它是由于聽神經受累所導致,發病率不高,大多為單側性,不易及時發現,治療困難,可成為永久性耳聾。其他并發癥還包括心肌炎,比較常見,而腎炎,乳腺炎,胸腺炎,甲狀腺炎,淚腺炎,角膜炎和血小板減少以及關節炎等偶可發生。