結核性腦膜炎的炎癥可以蔓延至大腦的實質或者腦實質原已有結核病變和導致結核性腦膜腦炎,少數病例腦實質內有結核瘤,有些患者還會出現腦積水及室管炎、室管膜及脈絡叢受累出現腦室管膜炎。
如室管膜或者脈絡叢結核病變使一側水腫和黏連或者雙側室間孔控粘連狹窄,可導致出現一側或者雙側的腦室擴張,腦底部滲出物機化、黏連、并且堵塞從而使腦脊液循環受阻可導致患兒出現腦積水。有一部分患兒還表現為脊髓病變,這是由于炎癥蔓延至脊髓、脊膜以及脊神經根,導致脊膜腫脹充血黏連,蛛網膜下腔完全閉塞。
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