情感障礙有關的睡眠癥按照發病機制,目前來說還不是非常的明確。但是,睡眠和覺醒的神經生化調節和情感障礙的發病機制有很多的講述之間是相互聯系的,降低了腦內去鉀腎上腺素為出現快速眼動相睡眠的增加,提高腦內去鉀腎上腺素,會使出現快速眼動像睡眠減少;五羥色胺與睡眠的關系也是非常密切的,五羥色胺作為產生睡眠的重要遞質,并且和快速眼動像睡眠發生關系密切。
γ氨基丁酸和睡眠關系,強光會引起睡眠當中腦細胞的γ氨基丁酸的水平增加,去甲腎上腺素和五羥色胺、γ氨基丁酸,在情感性障礙,特別是抑郁癥發病中的重要作用,就推測這些神經遞質的異常和情感障礙和相關的睡眠障礙的發病機制有關系。