許多臨床資料表明,家庭中某一個成員患系統性紅斑狼瘡,則其他成員的發病率會增加,有5%到12%的一級親屬,包括父母兄弟姐妹會出現狼瘡發病;在單卵雙生同胞中,如果其中一人發病,則另外一人發病的可能性為25%到50%;對于異卵雙生者,如果一人患病,則另一人患病的幾率為5%。
人類遺傳基因研究也發現,某些人類白細胞抗原與系統性紅斑狼瘡的發病有關,先天性補體C2C4的缺乏,也容易發生系統性紅斑狼瘡。
目前世界上許多風濕病學家正在尋找導致系統性紅斑狼瘡的致病基因,企圖從根本上控制狼瘡的發生,但是狼瘡的發病是多因素的,遺傳因素作為一個內因,還要有某些外在因素的參與下才可能發病。