在病理方面,維生素b1缺乏,常累及神經系統和心血管系統,以神經系統病變為主,無充血性心力衰竭則稱為干性腳氣病,以心血管病變為主,出現充血性心力衰竭則稱為濕性腳氣病。干性腳氣病侵犯周圍神經,為非炎癥性的一些變形,嚴重者侵犯中腦上部,中腦血管兒周圍的回執,丘腦下部。
濕性腳氣病等病理變化屬于非特異性的改變,生理方面的發病機制主要是維生素b1轉變為tpp后,作為輔酶參與丙酮酸脫氫和其他的一些組織的過程,維生素b1缺乏減少以輔酶的一些輔助過程,所以說會導致周圍的血管阻力下降,血循環加速,回心血量的增加,使心排血量增加,同時導致動靜脈分流增加。