有少數的個案報道顯示,精神藥物對于非器質性的遺糞癥,具有一定的治療作用,比方說丙咪嗪,能夠有效改善非器質性遺糞癥的癥狀,劑量相對比較低,為25毫克到75毫克每天,服藥后幾天到兩周以內起效,還有個別的一些案例報道是,阿米替林有效治療非器質性遺糞癥的這種患者,也有報道顯示說,對于一些注意缺陷多動癥的兒童合并一些非器質性遺糞癥的患者,利用托莫西汀治療以后,遺糞癥也得到了比較好的控制。
于此同時,由于三環類抗抑郁藥,可能會加重便秘癥狀,因此在滯留型非器質性遺糞癥的治療上,不建議選擇三環類藥物治療,也有報告說是針灸、按摩,中藥治療有一定的療效。
綜合治療對于非器質性遺糞癥治療十分重要,對于存在便秘和溢出性失禁的患兒,更是如此,在接受行為治療,腸排空以及緩瀉藥,或者是大便柔軟劑維持治療的兒童當中,癥狀完全緩解率為63%,而在僅僅接受行為治療的患兒當中,這種癥狀完全緩解率達到43%。