?先前的感染仍可在之后的階段內繼續出現,由于持續的免疫抑制狀態更多的疾病將在術后一個月后出現,大多在正常宿主不會發病的病原體有可能導致嚴重疾病。
這個階段尤其應該重視各種機會感染的出現,單純皰疹病毒以及皰疹病毒、HHV6在術后一個月內被激活,其他潛在的皰疹病毒也可在術后一到六個月內激活,如cmv和eb病毒。
值得注意的是cmv病毒感染的視網膜炎,通常不會在這個階段而出現,常于六個月之后出現,各種真菌可以在這個階段感染。當存在曲霉菌暴露的可能時,預防性應用抗真菌藥物非常關鍵,為了減少卡氏肺囊蟲肺炎、弓形蟲、單核細胞增多性氏菌和諾卡氏菌的發病,建議應用磺胺類藥物。