這個疾病臨床上主要決定于左心室流出道有無壓力差以及壓力差的程度,這一個癥狀主要是勞力性的呼吸困難,約80%的病人勞累后會出現呼吸的急促,這與左室順應差充盈受阻,還有舒張末期的壓力升高,肺淤血有關系,而且還有非典型的心絞痛,因為勞累過度,持續時間較長,對硝酸甘油的反應也是不佳的。
可能由于肥厚的心肌需要血流量的增加,冠狀動脈壓供應是相對不足的,有心肌缺血的表現。有頻發的一過性的暈厥,有的人發生于突然站立或運動后的暈厥,片刻后可以自行緩解,這種癥狀有時候是病人唯一的主訴,發生暈厥的原因可能是因為左心室順應性差,和流出道梗阻,造成了心排血量的降低,導致體循環和腦循環的供血不足。