常見的并發癥有營養性貧血,以小細胞低色素性貧血最為常見,貧血與缺乏鐵、葉酸、維生素B12、蛋白質等造血原料有關系,營養不良可以有多種維生素缺乏,尤其是脂溶性維生素A、D缺乏常見。
在營養不良的時候維生素D缺乏的癥狀不明顯,在恢復期生長發育加快時癥狀比較突出,約有四分之三的病兒伴有鋅缺乏。由于免疫功能低下,故經常容易患各種感染,比如反復的上呼吸道感染,鵝口瘡,真菌感染,肺炎,結核病,中耳炎,尿路感染等。
嬰兒腹瀉通常遷延不愈,加重營養不良,容易形成惡性循環。營養不良還可能并發自發性的低血糖,患兒可以突然表現為面色灰白,神志不清,脈搏減慢,呼吸暫停,體溫不升,但是沒有抽搐,如果不及時診治可以導致死亡。