局部注射糖皮質激素絕對禁忌癥包括注射部位皮膚感染,或全身感染,因為糖皮質激素可能都會導致深部的感染和關節軟組織的感染,因為可能會導致感染惡化,同樣由于存在感染的風險,手術前三個月內,不能在需要更換的關節內局部注射糖皮質激素,抗凝治療不是局部注射糖皮質激素的禁忌癥。
局部注射糖皮質激素的全身不良反應,包括血糖濃度升高達到48小時,睡眠障礙、潮紅。糖皮質激素注射的局部不良反應,包括肌肉骨骼疾病的暫時惡化,皮膚色素減退和組織萎縮。
如果涉及到重要的負重的肌腱,肌腱注射糖皮質激素是非常謹慎的,化膿性關節炎是關節內糖皮質激素注射的一種,比較嚴重,但是比較罕見的并發癥,如果局部注射糖皮質激素,在較長的時間內有效,而且缺乏更安全的替代治療的情況下可以重復。