因為滴蟲性陰道炎可同時有尿道、尿道旁腺、前庭大腺滴蟲感染,治愈此病需要全身用藥,主要治療藥物為甲硝唑及替硝唑。
第一個,全身用藥,就是口服甲硝唑或是替硝唑,劑量要根據當時醫生給開的劑量吃,因為這兩種藥服藥以后可能有胃腸道反應,如果胃腸道反應很嚴重就需要停藥,然后甲硝唑用藥期間以及停藥的24小時內、替硝唑用藥期間以及停藥72小時內禁止飲酒,哺乳期用藥不宜哺乳。
第二個,是性伴侶的治療,因為滴蟲性陰道炎主要是由性行為傳播,性伴侶應同時進行治療,并且要在治愈前避免無保護的性生活。
第三個,隨訪及治療失敗的處理,由于滴蟲性陰道炎患者再感染率很高,考慮對患有滴蟲性陰道炎的性活躍女性,在最初感染三個月后重新要進行篩查,如果有治療失敗的,需要增加甲硝唑療程及劑量。
在治療中間有需要注意的是,有復發癥狀的病例多數為重復感染,為了避免重復感染,內褲及洗滌用的毛巾應該煮沸五到十分鐘,以消滅病原體,并且性伴侶要同時治療。因為滴蟲性陰道炎可以合并其他的性傳播疾病,因此在檢查應該注意有無其他的性傳播疾病。