包皮環切手術適用于包莖的患者,特別是患兒因包皮的狹窄妨礙排尿或者反復包皮龜頭炎。成年人患有包莖導致反復包皮龜頭炎,兒童期的包皮過長是正常的,嬰兒有包莖或者兒童有包皮過長,如果沒有并發癥可以不用做包皮環切手術,因為三歲以下的小孩的包莖隨著年齡的增長而自行消失。另外,有一部分兒童只要反復將包皮向上外翻擴大,包皮口就會露出陰莖頭,也不必要手術切除。
小陰莖是指陰莖發育比較小,與年齡不符,但是外觀是正常,長度和直徑比值也是正常的,體格檢查一般沒有陰囊,睪丸下降不全等畸形,如果包皮過長合并有小陰莖是可以同時做手術的。