除了大動脈粥樣硬化引起的動脈到動脈的栓塞比較常見外,心源性腦栓塞是最為常見的一種嚴重的腦栓塞類型。
引起心源性栓塞的疾病主要是心房纖顫、心房撲動、心臟瓣膜病、人工心臟瓣膜、感染性心內膜炎、心肌梗死、心肌病、心力衰竭、心臟粘液瘤等等。
存在以上疾病時,在心臟內壁和半膜形成的血栓和贅生物脫落后可阻塞腦動脈,引起腦栓塞。存在右向左分流的心臟病,如卵圓孔未閉等可導致靜脈系統的栓子不經肺循環,而直接進入做左心,隨著血流到達腦動脈引起反常性栓塞,心房顫動是心源性栓塞最常見的原因,心房顫動的發病率隨著年齡增加而增加,陣發性心房顫動也會增加腦栓塞的風險。