根據細胞組織學特點可分為普通型,間葉型,去分化型,透明細胞型以及粘液型軟骨肉瘤等。根據軟骨肉瘤發生的解剖學部位分可將其分為中央型和外周型。根據發生來源軟骨肉瘤又可分為原發性和繼發性軟骨肉瘤。
原發性軟骨肉瘤和中央型軟骨肉瘤很少繼發于良性病變,因此中央型軟骨瘤多指原發性軟骨肉瘤。原發性軟骨肉瘤又可分為傳統型,透明細胞型,間質型,粘液型,去分化型,骨膜型,滑膜型以及骨外型軟骨肉瘤。
繼發性軟骨肉瘤,外周型軟骨肉瘤多繼發于良性病變,如骨軟骨肉瘤等,因此外周型軟骨肉瘤多指繼發性軟骨肉瘤,繼發性軟骨肉瘤又可分為內生軟骨瘤和內生軟骨肉瘤病的惡變,骨軟骨瘤和多發外生骨瘤繼發于滑膜軟骨瘤病的軟骨肉瘤,放療后導致軟骨肉瘤。