胃鏡檢查及活檢是最可靠的診斷方法。胃鏡診斷應包括病變部位、萎縮程度、腸化生及不典型增生的程度。肉眼直視觀察萎縮性胃炎的黏膜多呈蒼白或灰白,皺襞變細或平坦,黏膜可表現紅白相間,嚴重者有散在白色斑塊。
黏膜下血管顯露為萎縮性胃炎的特征,可見到紅色網狀小動脈或毛細血管、嚴重的萎縮性胃炎。可見有上皮細胞增生形成細小顆粒或較大結節,也有黏膜糜爛、出血現象。胃黏膜活檢病理主要為腺體不同程度萎縮、消失,代之以幽門腺化生或腸腺化生,間質炎癥浸潤也是很顯著的。
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