口腔潰瘍的發生是多種因素綜合作用的結果,其包括局部創傷,精神緊張,藥物,食物,營養不良,激素水平改變及維生素或微量元素缺乏。系統性疾病,遺傳,免疫及微生物在口腔潰瘍的發生發展中可能起重要作用,如缺乏微量元素鋅,鐵,缺乏葉酸,維生素b12及營養不良等,可降低免疫功能,增加口腔潰瘍發病的可能性。
血鏈球菌及幽門螺旋桿菌等細菌也與口腔潰瘍關系密切,口腔潰瘍通常預示著機體可能有潛在的系統性疾病。口腔潰瘍與胃潰瘍,十二指腸潰瘍,潰瘍性結腸炎,局限性腸炎,肝炎,女性經期維生素b族吸收障礙癥,植物神經功能紊亂癥有關。