腸阿米巴腸病潛伏期長短不一樣,自一到兩周至數月以上不等,雖然患者早已受到溶組織內阿米巴包囊感染,僅以共棲生存,當宿主抵抗力減弱以及腸道內感染等臨床上才出現癥狀。
急性的典型阿米巴腸病起病往往緩慢,以腹痛、腹瀉開始,大便次數逐漸增加,每天可達十到十五次之多,大便的時候有不同程度的腹痛以及里急后重。后者表示病變已經波及直腸,大便帶血和黏液,多呈暗紅色或紫紅色,呈糊狀,有腥臭味。病情較重者可以為血便或者白色黏液上覆蓋有少許鮮紅色的血液。患者全身癥狀較輕,在早期體溫和白細胞計數可有升高,糞便中能夠查到滋養體。