因發病部位及有無轉移而各異,最常見的部位為骨髓,骨皮質,肝臟,皮膚,而肺和腦轉移較少,遠處淋巴結轉移也較常見。原發于腎上腺或者脊柱旁的腫瘤,50%以上可在腹部捫及,腫塊往往體積大,質地硬,結節狀有時張力高。
縱膈病變可引起呼吸道癥狀,提示腫瘤侵及星狀神經節,眼球突出和雙側眼眶瘀血提示有眼眶轉移。全身癥狀如發熱,貧血,體重減輕,營養不良及骨關節疼痛的常見于進展期病例。
下肢骨轉移時因腿疼而不能行走。由于釋放兒茶酚胺,高血壓占35%,截癱或者馬尾綜合征是由于腫瘤侵入椎間孔進入硬膜外腔所致。盆腔腫塊還可壓迫膀胱和直腸,少見癥狀包括小腦共濟失調和眼肌陣攣。這可能是因為抗神經母細胞瘤抗體與小腦坡跟葉細胞發生交叉反應所致,而不是腫瘤轉移引起。
有些新生兒腫瘤釋放VAP可致水樣腹瀉。幼小嬰兒可因腫瘤浸潤導致肝大,多個皮下腫瘤結節。晚期患者因肝大,橫膈上升至呼吸窘迫,胃食管反流和凝血性疾病,有的神經母細胞瘤在產前經超聲檢查意外發現有關。